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最近在念一些phosphorylation相關的paper，碰到很多不懂的生字，感覺這些生字都很像...真的不好記 
‧kinase 激酶
將磷醯基(磷酸鹽)從ATP或其他高能磷酸鹽轉移到一個受體分子的酶。
‧MAP Kinase (MAPK) 促有絲分裂原活化蛋白激酶
Mitogen-Associated Protein Kinase
MAPK pathway
能催化磷酸基加成於一分子上的酶。
‧protein kinase 蛋白激酶
‧phosphoprotein 磷蛋白
一類帶有磷酸基的蛋白質，磷酸基是蛋白質合成後，由蛋白激酶催化加成的。
‧phosphatase 磷酸酶類
‧protein phosphatase 蛋白質磷酸酶
將磷酸基從蛋白質移除的酶，通常是將以前的磷酸化作用逆轉。
‧phosphorylation 磷酸化作用
‧TATA BOX
很多真核生物基因中在轉錄起始點上游的保守序列，參與起始轉錄必需的轉錄因子和RNA聚合酶複合物的結合。
‧TATA box binding factor/protein (TBF, TBP)
與很多真核生物基因的啟動子內的TATA box結合組成轉錄起始複合物的轉錄因子TFIID亞基。
‧histone 組織蛋白
蛋白蛋是生命體內最重要的成分，細胞的生長有成千成萬的蛋白質參與，舉凡細胞內的代謝途徑、生長、分化、荷爾蒙的分泌等等，都需要依賴它的相互作用及其嚴密地調節。其中最重要的調控機轉之一，就是可逆性的蛋白質磷酸化作用。每一種酵素、荷爾蒙、生長素及其他有生物活性之蛋白質都有它特有的立體構造，其功能就是依靠此種構造上的特異性來完成。蛋白質上加上一個或多個磷酸根，不但會改變它的立體形狀，並且會改變它的表面上電荷，因而就會改變它的功能或表現其他之功能。
磷酸化蛋白的量與其顯現之功能呈正相關，而它的量則受制於磷酸激酶(phosphokinase)及去磷酸酶(phosphatase)的相對活性。這種蛋白質上的磷酸化及去磷酸化作用如今已成為生物代謝中主要的調控機轉。
去年諾貝爾獎頒給費雪及柯瑞伯的理由主要在表揚他們在五十年代，研究肝醣代謝之一的磷酸化酶(phosphorylase)時首先發現這種調控機轉。 早期他們共同研究肝醣磷酸化酶(phosphorylase)在細胞中是如何被磷酸化時發現，肝醣磷酸化酶並不是直接被CAMP磷酸化，而是經由另一種磷酸化酶激酶(phosphorylase kinase)來完成，隨後他們又發現這種激酶的活性也受到磷酸化的調控，並終於找到了使肝醣磷酸化酶激酶活化的激酶(phosphorylase kinase kinasee)，由於這種酵素的受質(substrate)範圍很廣，細胞內很多蛋白酶或酵素都會被它磷酸化故又稱之“CAMP dependent protein kinase”。由於此一劃時代的發現，使得蛋白質的磷酸化及去磷酸化作用已為今日生物代謝上最重要的研究主題。
‧kinase 激酶
Any enzyme that transfers a phosphoryl (phosphate) group from ATP or other high-energy phosphates to an acceptor molecule.
將磷醯基(磷酸鹽)從ATP或其他高能磷酸鹽轉移到一個受體分子的酶。
‧MAP Kinase (MAPK) 促有絲分裂原活化蛋白激酶
Mitogen-Associated Protein Kinase
A serine-threonine protein kinase whose activity is stimulated by the action of many growth factors and other cytokines. It lies at the end of an intracellular signalling pathway and phosphorylates and activates transcription factors, resulting in changes in gene expression.
一種絲胺酸-蘇胺酸蛋白激酶。其活性可被多種生長因子及其他細胞素激發。它處於細胞內信號途徑的末端。其作用為將轉錄因子磷酸化並使其激活從而影響基因表現。
MAPK pathway
(the graph from wiki)
‧phosphokinase 磷酸激酶
Enzyme that catalyses the addition of phosphoryl groups to a moelcule.
能催化磷酸基加成於一分子上的酶。
‧protein kinase 蛋白激酶
Enzyme that phosphorylates specific amino acid residues in a protein. Protein kinases phosphorylate either serine and threonine residues, or tyrosine residues. They are an important component of intracellular pathways that requlate enzyme activity and relay extracellular signals to the intracellular respones machinery.
一類使蛋白質分子中特定胺基酸殘基磷酸化的酶。蛋白激酶將絲胺酸和蘇胺酸殘基磷酸化，或將酪胺酸殘基磷酸化。蛋白基酶為調控酶活性及將胞外的信號與胞內的反應機制聯繫的胞內途徑的重要成分。
‧phosphoprotein 磷蛋白
Protein carrying phosphoryl groups, which are added by protein kinases after the protein has been synthesized.
一類帶有磷酸基的蛋白質，磷酸基是蛋白質合成後，由蛋白激酶催化加成的。
‧phosphatase 磷酸酶類
Any of a large group of widely distrbuted enzymes catalysing the hydrolysis of organic phophate esters and the transfer of a phosphate group from one compound to another. Protein phosphatases catalyse the hydrolytic removal of phosphate (phosphoryl) groups from proteins.
分佈廣泛的一大類酶中任何一種，能催化有機磷酸酯的水解，也能催化磷酸基由一化合物轉移到另一化合物。蛋白質磷酸脂酶能催化從蛋白質中水解除去磷酸鹽基(磷醯基)。
‧protein phosphatase 蛋白質磷酸酶
enzyme that removes a phosphate group from a protein, often reversing the effect of a previous phosphorylation.
將磷酸基從蛋白質移除的酶，通常是將以前的磷酸化作用逆轉。
‧phosphorylation 磷酸化作用
The addition of a phosphate (phosphoryl) group to a molecule. The enzymatic phosphorylation of proteins at specific amino acids by protein kinases is a widespread means of altering a protein's activity.
磷酸基加入一個分子上的作用。使蛋白質分子的特定胺基酸位點進行酶促磷酸化，是改變其活性的一種廣泛採用的方式。
‧TATA BOX
Conserved sequence preceding the startpoint of transcription in many eukaryotic genes, involved in the binding of the complex of transcription factor proteins and RNA polymerase required for initiation of transcription.
很多真核生物基因中在轉錄起始點上游的保守序列，參與起始轉錄必需的轉錄因子和RNA聚合酶複合物的結合。
‧TATA box binding factor/protein (TBF, TBP)
Protein subunit of the transcription factor TFIID that binds to the TATA box in the promoters of many eukaryotic genes, and on which the transcription initiation complex is formed.
與很多真核生物基因的啟動子內的TATA box結合組成轉錄起始複合物的轉錄因子TFIID亞基。
‧histone 組織蛋白
Any one of a set of simple basic proteins (H1,H2A, H2B, H3, H4), rich in arginine and lysine, bound to DNA in eukaryote chromosomes to form nucleosomes.
一組簡單的基本蛋白質(H1,H2A, H2B, H3, H4)之一，富含精胺酸和賴胺酸，在真核細胞核染色體中與DNA結合形成核小體。
『補充』
蛋白蛋是生命體內最重要的成分，細胞的生長有成千成萬的蛋白質參與，舉凡細胞內的代謝途徑、生長、分化、荷爾蒙的分泌等等，都需要依賴它的相互作用及其嚴密地調節。其中最重要的調控機轉之一，就是可逆性的蛋白質磷酸化作用。每一種酵素、荷爾蒙、生長素及其他有生物活性之蛋白質都有它特有的立體構造，其功能就是依靠此種構造上的特異性來完成。蛋白質上加上一個或多個磷酸根，不但會改變它的立體形狀，並且會改變它的表面上電荷，因而就會改變它的功能或表現其他之功能。
磷酸化蛋白的量與其顯現之功能呈正相關，而它的量則受制於磷酸激酶(phosphokinase)及去磷酸酶(phosphatase)的相對活性。這種蛋白質上的磷酸化及去磷酸化作用如今已成為生物代謝中主要的調控機轉。
去年諾貝爾獎頒給費雪及柯瑞伯的理由主要在表揚他們在五十年代，研究肝醣代謝之一的磷酸化酶(phosphorylase)時首先發現這種調控機轉。 早期他們共同研究肝醣磷酸化酶(phosphorylase)在細胞中是如何被磷酸化時發現，肝醣磷酸化酶並不是直接被CAMP磷酸化，而是經由另一種磷酸化酶激酶(phosphorylase kinase)來完成，隨後他們又發現這種激酶的活性也受到磷酸化的調控，並終於找到了使肝醣磷酸化酶激酶活化的激酶(phosphorylase kinase kinasee)，由於這種酵素的受質(substrate)範圍很廣，細胞內很多蛋白酶或酵素都會被它磷酸化故又稱之“CAMP dependent protein kinase”。由於此一劃時代的發現，使得蛋白質的磷酸化及去磷酸化作用已為今日生物代謝上最重要的研究主題。
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